Материнская плата ASUS M5A99FX PRO R2.0 создана для использования многоядерных процессоров AMD AM3+. Чипсет AMD 990FX использует системную шину HyperTransport с пропускной способностью до 5200 МТ/с и четыре графических разъема PCI Express x16 для гарантирования широких возможностей разгона. Установлено четыре слота DDR3 памяти с максимальной частотой 2133 МГц и максимальным объемом 32 ГБ. Размер платы, согласно стандарту форм-фактора ATX, составляет 305х244 мм.
В ASUS M5A99FX PRO R2.0 доступно семь SATA портов со скоростью 6 Гбит/с, а также усовершенствованный eSATA-интерфейс с поддержкой «горячей замены» и более длинным кабелем. В наличии 4 варианта работы RAID (0, 1, 10, 5), что позволяет подобрать нужный дисковый массив. Для двух входов USB 3.0 предоставлена поддержка протокола UASP, что увеличивает скорость передачи информации на 70%. Сетевой адаптер, благодаря чипсету Realtek RTL8111F, развивает скорость до 1 Гбит/с и обладает контролером сети Ethernet.